270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1519 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.2 
 
 
298 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  54.92 
 
 
305 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  48.78 
 
 
333 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  50.67 
 
 
322 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  48.54 
 
 
330 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  47.56 
 
 
333 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  48.33 
 
 
334 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  48.16 
 
 
315 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.64 
 
 
311 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  38.08 
 
 
466 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  48.67 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  41.06 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.54 
 
 
305 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  43.98 
 
 
313 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  39.54 
 
 
317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  39.22 
 
 
317 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  39.54 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  38.33 
 
 
312 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  38.14 
 
 
323 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  39 
 
 
325 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  40.94 
 
 
311 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  40.6 
 
 
311 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  38.36 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  38.36 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  38.23 
 
 
311 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.21 
 
 
302 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.8 
 
 
333 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
327 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.25 
 
 
346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 
328 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.13 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  33.11 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 
325 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
325 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
325 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 
341 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 
325 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.53 
 
 
326 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.48 
 
 
316 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  32.12 
 
 
298 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  37.36 
 
 
312 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 
319 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.08 
 
 
297 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 
325 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.02 
 
 
310 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 
324 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.23 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.84 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
324 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.3 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 
350 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.61 
 
 
313 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.97 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.07 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.89 
 
 
289 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  32.04 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.74 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 
357 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.47 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.63 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.07 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  34.31 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.51 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  31.94 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  32.94 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  24.21 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.47 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.78 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.914602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>