More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3081 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
329 aa  654    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  53.85 
 
 
329 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  55.08 
 
 
330 aa  329  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  55.91 
 
 
331 aa  328  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  53.82 
 
 
351 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  52.26 
 
 
359 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  49.7 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  46.33 
 
 
326 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  46.56 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  272  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  45.31 
 
 
319 aa  271  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  45.31 
 
 
320 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  45.65 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  46.23 
 
 
313 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  44.33 
 
 
324 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  45.58 
 
 
311 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 
325 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37 
 
 
302 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 
325 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 
325 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 
325 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
325 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
316 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.93 
 
 
345 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 
329 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 
325 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  31.37 
 
 
323 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.06 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 
331 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.24 
 
 
340 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 
325 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
326 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  36.16 
 
 
316 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 
333 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 
328 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 
328 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 
326 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  34.18 
 
 
316 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.45 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
336 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 
319 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
336 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 
315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
336 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
336 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.26 
 
 
329 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
330 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 
345 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 
328 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  34.63 
 
 
338 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 
321 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 
323 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 
327 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 
354 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 
332 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  35.48 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  35.76 
 
 
330 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  26.02 
 
 
337 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  31.63 
 
 
349 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.39 
 
 
330 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.55 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  34 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 
346 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  33.1 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 
350 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 
366 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.97 
 
 
330 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 
348 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 
320 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  34.42 
 
 
330 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 
338 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 
358 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 
314 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  35.67 
 
 
312 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  34.09 
 
 
334 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 
319 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 
349 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 
321 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 
349 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>