297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5996 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  51.93 
 
 
306 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.93 
 
 
296 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.73 
 
 
315 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  48.18 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.96 
 
 
348 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  38.83 
 
 
328 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  44.12 
 
 
318 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40 
 
 
310 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  35.87 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 
325 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  35.65 
 
 
316 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  35.61 
 
 
325 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.79 
 
 
302 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 
325 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.09 
 
 
323 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.35 
 
 
325 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 
325 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.78 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  42.18 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  36.66 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 
314 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.83 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.54 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  36.54 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 
318 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 
316 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.71 
 
 
329 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 
315 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
338 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 
316 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  36.54 
 
 
305 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  41.31 
 
 
315 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.98 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.04 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 
331 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.39 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 
311 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.32 
 
 
321 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  34.65 
 
 
318 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 
338 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 
318 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.63 
 
 
328 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.84 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.21 
 
 
326 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  39.3 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.08 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 
319 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 
324 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.89 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.76 
 
 
316 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34.24 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 
317 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.54 
 
 
326 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  37.09 
 
 
310 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  35.36 
 
 
315 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 
342 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 
330 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.21 
 
 
312 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
313 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  35.52 
 
 
330 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.83 
 
 
311 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  36.02 
 
 
319 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.38 
 
 
351 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 
329 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.93 
 
 
332 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  27.95 
 
 
341 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 
318 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  30.92 
 
 
466 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
305 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.05 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.05 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  36.56 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.87 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.59 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>