295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0460 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  55.52 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  36 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  31.82 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.49 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.28 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  37.19 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.31 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.79 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.18 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.54 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.66 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.55 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  37.32 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  37.16 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  36.03 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.78 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  35.08 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  29.09 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.86 
 
 		 351 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.61 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  29.01 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.52 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.08 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.94 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.07 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.87 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  28.91 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  34.51 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.6 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  28.47 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.2 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  29 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  29 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  35.42 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.2 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  35.63 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.65 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  33.82 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.05 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.2 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.82 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  30.65 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 340 aa  89  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  32.69 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.51 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>