274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1386 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 320 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  44.48 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  42.52 
 
 		 310 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.43 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.02 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.3 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.9 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.21 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  25.9 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.33 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.94 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  26.77 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.21 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.4 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.75 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.2 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.06 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.35 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  25.95 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.62 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.24 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.24 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.35 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.33 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.22 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.72 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  29.41 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  25.29 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  31.78 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  30.41 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.69 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.88 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.78 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  24.89 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.19 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.31 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.57 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.57 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.34 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  28.05 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.19 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.35 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  32.64 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.13 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  29.12 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.52 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.04 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  23.99 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.77 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.43 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.37 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>