225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0365 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 324 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 324 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  97.84 
 
 		 320 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  89.51 
 
 		 320 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  92.59 
 
 		 320 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  85.49 
 
 		 323 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  88.58 
 
 		 320 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  71.84 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.22 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  56.13 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14020  hypothetical protein  56.13 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  54.31 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  55.16 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.8 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 313 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.67 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.58 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  24.34 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  24.58 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.57 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.5 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  22.38 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  23.08 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  22.38 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.26 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  22.38 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  28.71 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  23.55 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  30.52 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  24.9 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  24.49 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  23.66 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  22.69 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  24 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  29.31 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.73 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  25.96 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  22.44 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  20.75 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.4 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.12 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  27.69 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  25.23 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  26.88 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  23.43 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  26.88 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.81 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  24.69 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.76 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.2 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  25.3 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.24 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  23.96 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  22.26 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  25.76 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.84 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  25.51 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  29.78 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  25.7 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  29.94 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.6 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  27.96 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>