239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3431 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 321 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  70.57 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  73.08 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  72.44 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  72.12 
 
 		 320 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  70.79 
 
 		 323 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  71.84 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  71.84 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  71.15 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  52.58 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14020  hypothetical protein  54.81 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  54.49 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  54.63 
 
 		 319 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.32 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.99 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.01 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.19 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.53 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  28.37 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.72 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.91 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  23.25 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.33 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.62 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.31 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.39 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.25 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  24.76 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  24.52 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.88 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.48 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  21.43 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  27.86 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.32 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  22.7 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.43 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.78 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  30.64 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  22.13 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  24.55 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  28.04 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.22 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.69 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  22.95 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  22.67 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  25.41 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  25.41 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  22.89 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  22.89 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  22.89 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.89 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  24.83 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.31 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  23.64 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  27.34 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  21.18 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.21 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.67 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  27.9 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  27.9 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  23.67 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.04 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>