More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5043 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 319 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  40.18 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  35.58 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  38.6 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.41 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.26 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  37.05 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  38.12 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.19 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.83 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  31.66 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.88 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.73 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  36.58 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  38.49 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.48 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.19 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.02 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.25 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.22 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.03 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.97 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.02 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.38 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  35.54 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  32.54 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  34.94 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  34.41 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  30.15 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.61 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.53 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.82 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  34 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.02 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.96 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.96 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.44 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.1 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  26.07 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  34.84 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.2 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  30.09 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  33.95 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.57 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  35.2 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  31.75 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  35.13 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.95 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.75 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.02 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.44 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  37.43 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.03 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  31.12 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.94 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  35.51 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>