266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3176 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  100 
 
 		 327 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  69.25 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  69.7 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  69.54 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  66.77 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  65.03 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  61.88 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  60.74 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  61.77 
 
 		 327 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  61.59 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  59.57 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  61.11 
 
 		 333 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  47.96 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  59.76 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  59.15 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  58.84 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  58.84 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  59.76 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  52.61 
 
 		 319 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  41 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  39.66 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  38.98 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  37.23 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  37.23 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  34.05 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.96 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  36.65 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  39.35 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  34.78 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.23 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.35 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.85 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  40.93 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  36.41 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.56 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  36.9 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  36.82 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.6 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.28 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.85 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.85 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  38.84 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  31.68 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  35.1 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.17 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.2 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.93 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.46 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 354 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.25 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>