268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34775 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  100 
 
 
346 aa  708    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.52 
 
 
328 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 
326 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.23 
 
 
324 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.36 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.49 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  26.12 
 
 
325 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.53 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  25.77 
 
 
325 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.21 
 
 
348 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 
326 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 
319 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 
319 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 
312 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.21 
 
 
326 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 
328 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.34 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.68 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  27.11 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.79 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 
317 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 
329 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 
329 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  27.98 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.68 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 
314 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.8 
 
 
323 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.71 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  27.43 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.98 
 
 
318 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
314 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  29.78 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.15 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.36 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.24 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.79 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  26.47 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.44 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.78 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  28.1 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  26.92 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  26.24 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  29.37 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25.27 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  26.84 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  25.67 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.52 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  25.67 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.95 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>