280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3126 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 323 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  68.65 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  68.44 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  67.8 
 
 		 323 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  67.18 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  67.18 
 
 		 323 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  66.87 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  66.56 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  36.89 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  36.04 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  35.1 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  36.48 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.9 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.01 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  36.6 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  34.24 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.56 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  39.73 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.26 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.29 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.96 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.4 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.43 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.93 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.78 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.38 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.36 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.23 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.25 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.36 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.25 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.85 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.43 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34.88 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  38.49 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.21 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 365 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.46 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.46 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  33.66 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.79 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.34 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.92 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.89 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  31.35 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.81 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.71 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.23 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  31.92 
 
 		 352 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  34.13 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  33.2 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>