285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3761 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  74.42 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  67.45 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  51.16 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  42.52 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.97 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.28 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.46 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  35.28 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.25 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.19 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.43 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.38 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.76 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  34.8 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 350 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.34 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  36.04 
 
 		 359 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  37.27 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  34.55 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  35.84 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.29 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.47 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.02 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.13 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.71 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.51 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  36.53 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  36.28 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.89 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  35.14 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  35.59 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  35.59 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  34.74 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.28 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.64 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.36 
 
 		 346 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.7 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.26 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.83 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  36.84 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.48 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  27.21 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  25.51 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  34.62 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  36 
 
 		 353 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 382 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>