275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0121 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 382 aa  762    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  64.2 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  65.51 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  63.85 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  62.87 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  62.31 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  64.22 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  61.29 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  61.11 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  61.99 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  64.69 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  61.4 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  64.12 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  64.12 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  61.11 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  61.58 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  64.12 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  64.41 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  63.82 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  58.77 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  65.98 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  55.92 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  56.64 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  68.77 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  54.57 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  55.62 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  54.14 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  55.92 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  56.18 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  56.51 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  52.92 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  52.51 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  54.73 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  55.86 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  56.52 
 
 		 350 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  54.3 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  57.35 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  59.56 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  48.82 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  56.76 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  51.18 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.82 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.82 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.88 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.8 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.98 
 
 		 319 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  37.58 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.2 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  38.01 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.64 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  35.34 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.44 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  34.3 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.96 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.88 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 314 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 325 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.57 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.64 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  36.89 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.06 
 
 		 297 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 323 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.06 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  32.52 
 
 		 330 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  38.08 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.89 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  34.02 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 325 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 325 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.93 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>