265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0970 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 314 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14020  hypothetical protein  71.25 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  70.61 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  68.47 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.21 
 
 		 320 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.86 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.13 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.13 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  56.86 
 
 		 320 aa  331  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.43 
 
 		 322 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  54.37 
 
 		 323 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.21 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.58 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.07 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.72 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.94 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.83 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.45 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  26.84 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.77 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.32 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.96 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  28.26 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.76 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  26.8 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.97 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.57 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  23.72 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.71 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  22.95 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.87 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  26.55 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  26.19 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  26.8 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.58 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.12 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  28.63 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  25.22 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.11 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.35 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.14 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.06 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.83 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.43 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  28.32 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  25.23 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  23.97 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  25.45 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.66 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  27.13 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>