240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1116 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 355 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  79.76 
 
 		 340 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  66.87 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.97 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  54.52 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  54.52 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  27.81 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  27.2 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  26.68 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.11 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  24.74 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.78 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.69 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.76 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.47 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.24 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.12 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 		 319 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.75 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  30.23 
 
 		 707 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.32 
 
 		 685 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.43 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  26.42 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  24.5 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  26.77 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.63 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.65 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.53 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.84 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  27.93 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.12 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.64 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25.9 
 
 		 340 aa  93.2  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.9 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.38 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.28 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  32.64 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.26 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  29.53 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.86 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  28.24 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  24.22 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.28 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  27.34 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  26.99 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.04 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.91 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.25 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>