268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1795 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
366 aa  756    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  56.76 
 
 
358 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  55.59 
 
 
358 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  57.48 
 
 
348 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  55.29 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  55.16 
 
 
346 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  57.19 
 
 
357 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  55.36 
 
 
348 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  54.79 
 
 
358 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  52.51 
 
 
350 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  54.33 
 
 
351 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  52.54 
 
 
348 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  52.1 
 
 
350 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  52.54 
 
 
354 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  53.1 
 
 
353 aa  355  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  51.92 
 
 
350 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  50.3 
 
 
349 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  51.92 
 
 
350 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  51.33 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  55.02 
 
 
352 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  52.07 
 
 
349 aa  348  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  50.74 
 
 
365 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  49.27 
 
 
369 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  51.5 
 
 
359 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  49.57 
 
 
359 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  50.9 
 
 
359 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  51.2 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  52.6 
 
 
334 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 
340 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  48.82 
 
 
382 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  51.2 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  51.35 
 
 
343 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  51.05 
 
 
343 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  48.71 
 
 
359 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  48.52 
 
 
365 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  50.61 
 
 
362 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  49.85 
 
 
339 aa  328  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  46.88 
 
 
357 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  49.7 
 
 
350 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  48.94 
 
 
366 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  51.42 
 
 
328 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.66 
 
 
336 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.66 
 
 
336 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  37.72 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.39 
 
 
319 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 
329 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.74 
 
 
319 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.62 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.56 
 
 
324 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 
311 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.66 
 
 
326 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 
324 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
338 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 
331 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.36 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.17 
 
 
329 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 
325 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 
325 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.06 
 
 
325 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.48 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 
338 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 
337 aa  92.8  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.89 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 
325 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  29.44 
 
 
319 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.08 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.09 
 
 
316 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.08 
 
 
323 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  26.99 
 
 
316 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.63 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.07 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  26.71 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  27.64 
 
 
319 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  29.58 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  28.73 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.06 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  30.41 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  25.87 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  28.09 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  24.83 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  28.94 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>