274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1530 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
314 aa  633  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.4 
 
 
326 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.95 
 
 
324 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.47 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 
328 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.5 
 
 
316 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.24 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  24.13 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.95 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.95 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.7 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.02 
 
 
325 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.97 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  22.77 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.05 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.05 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.5 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  35.07 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.05 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  23.34 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.03 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.28 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.44 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.1 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  29.12 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.91 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.24 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  26.18 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  25.83 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  25.83 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.89 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.71 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  23.27 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  25.64 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  23.23 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.49 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.79 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.38 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.1 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.96 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  28.73 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.57 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  27.98 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  31.35 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  28.36 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  26.59 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.09 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  27.66 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  24.44 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  23.74 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  36.04 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  25.77 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>