236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1433 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  73.36 
 
 
289 aa  441  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1192  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  75.43 
 
 
289 aa  408  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  72.32 
 
 
288 aa  409  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.83 
 
 
304 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 
326 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
333 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.25 
 
 
326 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.73 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.17 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.82 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.81 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.67 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 
323 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.05 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.31 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.5 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.12 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.13 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.55 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.13 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  28.63 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  24.52 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  27.5 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  24.59 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.39 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  28.96 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.59 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.48 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.99 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.62 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.38 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 
325 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.66 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.34 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.51 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  27.5 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  26.57 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  25.86 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  25.86 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  25.86 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.13 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.09 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.05 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  26.04 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  27.2 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  25.7 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.65 
 
 
329 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  31.36 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25.23 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.07 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.57 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  24.14 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  25.46 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.16 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  29.77 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>