263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2754 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 339 aa  700    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  57.62 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  53.59 
 
 		 358 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  57.1 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  57.4 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  54.46 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  56.51 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  56.42 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  56.42 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  54.9 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  56.12 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  55.82 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  55.52 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  55.19 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  54.41 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  53.57 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  52.98 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  56.35 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  52.92 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  58.04 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  54.76 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  53.29 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  51.2 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  52.69 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  52.1 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  53.45 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  49.41 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  59.62 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  51.34 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  48.95 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  47.48 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  49.85 
 
 		 351 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  50.75 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  49.4 
 
 		 348 aa  341  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  49.85 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  52.85 
 
 		 343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  54.15 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  48.35 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  48.19 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  46.22 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  47.92 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  47.75 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  44.61 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  44.61 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.1 
 
 		 345 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.2 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.25 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32.94 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.09 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.98 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  29 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.09 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.8 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.17 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.84 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.84 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.14 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  28.05 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  27.71 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  23.1 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  26.16 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  25.54 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  31.12 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  28.74 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.1 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  28.77 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25.27 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.84 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  28.79 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.4 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>