287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0613 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  99.09 
 
 		 350 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 328 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  71.04 
 
 		 350 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  70.73 
 
 		 350 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  70.43 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  69.72 
 
 		 349 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  73.89 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  68.27 
 
 		 354 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  70.5 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  73.08 
 
 		 359 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  67.5 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  72.76 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  72.12 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  70.34 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  72.44 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  67.5 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  67.2 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  67.51 
 
 		 369 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  68.05 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  68.77 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  70.19 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  64.29 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  65.71 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  64.1 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  66.98 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  66.14 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  61.54 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  66.04 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  66.03 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  66.02 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  62.11 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  59.62 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  59.62 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  58.97 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  60.38 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  58.33 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  56.74 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  59.29 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  57.73 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  59.62 
 
 		 340 aa  349  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  51.42 
 
 		 366 aa  335  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  54.89 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  47.25 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  47.25 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  45.63 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  39.34 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  35.48 
 
 		 319 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.94 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  35.5 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.73 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  36.76 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  36.26 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.67 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.22 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.9 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.57 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  34.22 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  32.32 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.06 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  36.05 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  36.05 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  36.33 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.02 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  36.26 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.71 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  40.57 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  33.86 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.41 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.71 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.43 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.71 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>