282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5311 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  97.21 
 
 		 359 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  98.33 
 
 		 359 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  94.71 
 
 		 359 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 359 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  94.99 
 
 		 359 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  68.56 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  66.57 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  66.27 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  65.67 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  67.26 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  65.18 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  67.46 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  64.18 
 
 		 358 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  63.31 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  63.82 
 
 		 382 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  69.46 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  63.34 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  60.52 
 
 		 369 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  70.34 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  60.88 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  55.52 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  61.01 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  60 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  61.54 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  60.61 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  59.41 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  59.33 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  60.7 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  56.07 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  55.12 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  52.25 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  52.25 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  54.65 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  51.65 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  51.05 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  55.42 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  49.57 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  54.05 
 
 		 348 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  52.85 
 
 		 350 aa  355  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  50.9 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  52.35 
 
 		 340 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  51.45 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  44.94 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  44.94 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  41.52 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  36.26 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.09 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.56 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.96 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.39 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.35 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.6 
 
 		 323 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34.54 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.23 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.33 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.8 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 325 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 316 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.93 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.6 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.24 
 
 		 340 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.33 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  31.34 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>