223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35643 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  100 
 
 		 337 aa  692    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.86 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 247 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.4 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.22 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.14 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  31.45 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  34.01 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.22 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  31.54 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.22 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.76 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.16 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  32.59 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  32.59 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  25.88 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.82 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  33.22 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  29.28 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  33.77 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  32.13 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  32.41 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  31.96 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  28.81 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.45 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.03 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.02 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.95 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.14 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.33 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  28.64 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  28.07 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.03 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1414  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  29.95 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  28.05 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.93 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  27.9 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  28.77 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>