226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1414 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1414  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  25.91 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.45 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.74 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  35.98 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.93 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.63 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  28.71 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  29.59 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.45 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  25.94 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  33.79 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.4 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.61 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.9 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.39 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  34.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  25.91 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.47 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  25.61 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.33 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.13 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.29 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  25.15 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  31.94 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.88 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  27.91 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.58 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.49 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  33.61 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.38 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  23.77 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  25.53 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5501  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.42 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205355  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  33.63 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  28.94 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  24.77 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.07 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  34.95 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  29.74 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  39.62 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  25.51 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  26.48 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  25.39 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  26.91 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0752  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.46 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  25.59 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  32.17 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.36 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  41.59 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  38.41 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  41.59 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  25.72 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.82 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.7 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  25.5 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  24.59 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.1 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.17 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.54 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  23.05 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  27.95 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  22.13 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  22.13 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>