264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0752 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0752  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  60.28 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.77 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.62 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  35.32 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34.18 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.74 
 
 		 326 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.99 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.21 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.74 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.21 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.8 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  32.1 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  26.57 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.92 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.92 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.54 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.55 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.87 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.76 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.18 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.83 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.05 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.18 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  25.52 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 326 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  24.46 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  22.92 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.03 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  24.03 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.89 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.92 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 345 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  23.86 
 
 		 325 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 		 320 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 		 338 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.34 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  31.14 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.63 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.74 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.33 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  25.25 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.29 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  27.82 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  23.79 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.9 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  23.79 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  24.67 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.06 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  34.2 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  28.63 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>