75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5501 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5501  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 354 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205355  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  25.1 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.09 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1414  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.85 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  37.17 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.35 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.28 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  22.98 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.44 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  24.4 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  23 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  21.68 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  22.33 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  22.22 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.78 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  22.73 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  27.13 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25.59 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.27 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.62 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  32.74 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  29.05 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  28.04 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.96 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  24.19 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.82 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.62 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  24.1 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.12 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  25 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  23.62 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  23.83 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.18 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  20.52 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  20.52 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  23.43 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  30.83 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  22.76 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.01 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  22.59 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.55 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.75 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.24 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.89 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.12 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.54 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  28.28 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  24.78 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>