39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3802 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3802  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  48.94 
 
 		 316 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  49.45 
 
 		 315 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  47.25 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  46.05 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  40.79 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  40.79 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  41.03 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  36.14 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  40.79 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  37.18 
 
 		 321 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  40.51 
 
 		 330 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  42.31 
 
 		 319 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  37.36 
 
 		 320 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  38.96 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  38.96 
 
 		 326 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  38.1 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  38.1 
 
 		 330 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  38.67 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  40.26 
 
 		 331 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  41.03 
 
 		 326 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 321 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  38.16 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  35.44 
 
 		 324 aa  47.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 333 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  38.1 
 
 		 329 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  38.46 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.61 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 		 319 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  30.86 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  35.06 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 325 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 329 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  33.73 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 311 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 325 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>