264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1353 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 306 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  96.08 
 
 		 325 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6348  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.32 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.91 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.19 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.5 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1821  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.93 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  36.15 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  31.16 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  38.29 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.81 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  36.24 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.53 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.53 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  38.91 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.72 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.62 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.92 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.07 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.58 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.24 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.67 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  36.29 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.98 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.76 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.95 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.59 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.65 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.36 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  31.11 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  25.67 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  36.84 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  31.65 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.32 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  29.17 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  35.43 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.09 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  38.55 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  25.74 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  25.74 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.09 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  29.44 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.79 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.79 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  30.8 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.33 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.9 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>