90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44059 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_44059  predicted protein  100 
 
 		 355 aa  731    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273474  normal  0.171571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01730  PrnX protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HEN2]  32.91 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0887939  normal  0.0552396 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00454  proline utilization protein PrnX-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04440)  31.71 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.212442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.71 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.5 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.14 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.85 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.85 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.74 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  25.61 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.46 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.06 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.63 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.11 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  24.22 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  25.74 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.41 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  26.48 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.43 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.04 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  24.73 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  26.42 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  23.98 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.5 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  24.02 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.33 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  25.25 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  24.7 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  23.67 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.72 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.05 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  25.37 
 
 		 303 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  25.32 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.39 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  24.72 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  26.1 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.93 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  24.48 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  26.47 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  23.69 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  25.5 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  21.89 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  23.63 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.05 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  24.21 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  22.98 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  24.83 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  24.9 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24.15 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.57 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  24.49 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  23.3 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.59 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.65 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  21.03 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  22.68 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  23.4 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  24.26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02000  hypothetical protein  24.86 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0957145  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  25.91 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  24.6 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  24.44 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  22.3 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.62 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>