178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02000 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02000  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0957145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 
328 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01730  PrnX protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HEN2]  30.38 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0887939  normal  0.0552396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.25 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.09 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  38.89 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.81 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.36 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.08 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.18 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  27.46 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.14 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00454  proline utilization protein PrnX-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04440)  32.39 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.212442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  39.53 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.28 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.28 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.94 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  30.33 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.88 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.43 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.52 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.71 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.52 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.34 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  36.8 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  25.56 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  31.18 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  25.16 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.71 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.82 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.07 
 
 
298 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.88 
 
 
348 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.6 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44059  predicted protein  27.47 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273474  normal  0.171571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  35.45 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.07 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  33.8 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  36.09 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.51 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.64 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.41 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.09 
 
 
316 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.84 
 
 
320 aa  55.8  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  25.68 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  27.82 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.74 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.75 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 
342 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  23.92 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.14 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.31 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
326 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  29.2 
 
 
305 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  31.61 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  30.83 
 
 
316 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.79 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.24 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  23.77 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>