233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0976 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
318 aa  637    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  51.45 
 
 
312 aa  311  9e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 
318 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 
317 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  28.09 
 
 
344 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 
319 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.13 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  29 
 
 
328 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.13 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.77 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.13 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.66 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.93 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.43 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  24.84 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.29 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.81 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  24.24 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.98 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.53 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  24.02 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  26.78 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.4 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  24.67 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.85 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  22.55 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.04 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  22.36 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  25.38 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  25.21 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.17 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.83 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  24.89 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.64 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.91 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.5 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  22.75 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  25.46 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  24.44 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.29 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  22.7 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  23.74 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  21.8 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.58 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  25.52 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  24.55 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  30 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  24.12 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.03 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.19 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  21.77 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.18 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  23.41 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  23.88 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 
348 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.62 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  23.35 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25.21 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.86 
 
 
351 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  23.61 
 
 
319 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  23.39 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  23.17 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>