205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1864 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 332 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.11 
 
 		 333 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  44.34 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  42.01 
 
 		 707 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.68 
 
 		 685 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.58 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.75 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.15 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.99 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.21 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  32.54 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.29 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  31.43 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  28.97 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  28.97 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.48 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  26.16 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.67 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  47.79 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.98 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 		 411 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  27.08 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.47 
 
 		 326 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.34 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  26.55 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  24.48 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  24.56 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.16 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.7 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.18 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.38 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.61 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.61 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.16 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.66 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.36 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  25.56 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  24.65 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.95 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  24.65 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.06 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  23.51 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  24.56 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  26.01 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.9 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  26.95 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  24.25 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.95 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  26.39 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.75 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.96 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.76 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  26.72 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  24.4 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  23.85 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  22.39 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  23.03 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.53 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  26.04 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  25.17 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.08 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  23.72 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.98 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.11 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  26.25 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  25.76 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  24.05 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  23.53 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  23.22 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  36.45 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>