170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0367 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 333 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  53.33 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.11 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.3 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.55 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.6 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.24 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.67 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.1 
 
 		 685 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  40.74 
 
 		 707 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.89 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  31.91 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.54 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.12 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.49 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  44.23 
 
 		 394 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.81 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.25 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.69 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  31.34 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.06 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.85 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.24 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  29.38 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.31 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  24.88 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  24.7 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.94 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  30.39 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  25.29 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.7 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.27 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  25.53 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.09 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  24.4 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25.57 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  25.23 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  24.17 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  24.34 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.79 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  24.4 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.1 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.23 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  23.74 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.84 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  29.76 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  24.33 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  28.79 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  26.55 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.62 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.09 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  29.12 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.88 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.66 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  26.98 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  28.36 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  25.8 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3754  ornithine cyclodeaminase mu-crystallin  26.4 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00106555  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.14 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  25.9 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>