More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2745 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  85.43 
 
 
707 aa  1213    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
685 aa  1406    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  57.14 
 
 
322 aa  356  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.69 
 
 
341 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50.89 
 
 
344 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.68 
 
 
330 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.03 
 
 
330 aa  302  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.41 
 
 
363 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.59 
 
 
337 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  49.41 
 
 
341 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.67 
 
 
344 aa  267  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  46.92 
 
 
333 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  36.42 
 
 
325 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  44.1 
 
 
340 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  41.72 
 
 
338 aa  227  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.66 
 
 
326 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.66 
 
 
326 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.45 
 
 
336 aa  218  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  40.83 
 
 
338 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  37.19 
 
 
341 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
333 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.68 
 
 
332 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  36.3 
 
 
340 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.07 
 
 
364 aa  187  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.23 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.1 
 
 
333 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.63 
 
 
352 aa  171  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  34.73 
 
 
351 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  32.69 
 
 
372 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  36.25 
 
 
310 aa  157  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.31 
 
 
371 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.31 
 
 
371 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  29.52 
 
 
461 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  31.44 
 
 
302 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.37 
 
 
393 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.85 
 
 
333 aa  154  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  32.12 
 
 
454 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  34.38 
 
 
319 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.51 
 
 
369 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.51 
 
 
369 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  37.72 
 
 
310 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  32.03 
 
 
305 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.51 
 
 
369 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  32.62 
 
 
388 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  31.31 
 
 
379 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  28.96 
 
 
345 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.81 
 
 
465 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  32.73 
 
 
315 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  30.5 
 
 
456 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.82 
 
 
479 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  33.22 
 
 
336 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  30.46 
 
 
302 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.97 
 
 
346 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  38.11 
 
 
309 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  34.32 
 
 
320 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.45 
 
 
368 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  34.4 
 
 
302 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.46 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.91 
 
 
371 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  30.84 
 
 
308 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  31.35 
 
 
312 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  27.91 
 
 
302 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  33.33 
 
 
320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.78 
 
 
453 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.39 
 
 
456 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  35.23 
 
 
771 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  33.44 
 
 
309 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  36.11 
 
 
309 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  29.69 
 
 
326 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.33 
 
 
302 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  36.11 
 
 
309 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  30.36 
 
 
387 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  32.77 
 
 
318 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  31.95 
 
 
311 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  31.35 
 
 
312 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  33.33 
 
 
310 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  29.7 
 
 
304 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  32.58 
 
 
311 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  30.36 
 
 
764 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  29.19 
 
 
458 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  31 
 
 
324 aa  138  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  32.39 
 
 
372 aa  138  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  29.32 
 
 
306 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.9 
 
 
307 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  28.45 
 
 
349 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3684  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.88 
 
 
347 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  34.02 
 
 
315 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  30.84 
 
 
312 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  31.96 
 
 
457 aa  137  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  35.21 
 
 
313 aa  137  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  33.22 
 
 
303 aa  137  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.5 
 
 
456 aa  137  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  35.56 
 
 
320 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  28.44 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  32.62 
 
 
307 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  28.79 
 
 
317 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  30.51 
 
 
332 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  31.62 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.15 
 
 
304 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  30.84 
 
 
299 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>