More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3752 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  100 
 
 
351 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  50.61 
 
 
336 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.48 
 
 
338 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3684  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  49.09 
 
 
347 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  38.73 
 
 
456 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.43 
 
 
465 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  38.58 
 
 
455 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  39.82 
 
 
455 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.34 
 
 
461 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  37.92 
 
 
457 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  35.46 
 
 
372 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.07 
 
 
479 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  40.06 
 
 
455 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  37.01 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.7 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.66 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.72 
 
 
455 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  38.44 
 
 
454 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  36.58 
 
 
457 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  39.59 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  38.3 
 
 
463 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.18 
 
 
453 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  39.61 
 
 
305 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.44 
 
 
333 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  35.44 
 
 
341 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  36.89 
 
 
461 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  38.86 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  40 
 
 
456 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  37.21 
 
 
464 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  38.82 
 
 
456 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.43 
 
 
459 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  38.82 
 
 
456 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  37.62 
 
 
311 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  33.24 
 
 
458 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.33 
 
 
319 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  38.51 
 
 
464 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.03 
 
 
459 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  35.41 
 
 
312 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.72 
 
 
461 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 
456 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  36.94 
 
 
303 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.95 
 
 
302 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.03 
 
 
459 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  36.73 
 
 
454 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  36.31 
 
 
461 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  37.01 
 
 
464 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  35.08 
 
 
312 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.42 
 
 
461 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  36.84 
 
 
464 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  34.71 
 
 
459 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  33.95 
 
 
332 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  40.13 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.92 
 
 
307 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  33.02 
 
 
326 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.98 
 
 
368 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  37.01 
 
 
464 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.6 
 
 
333 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  37.54 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  37.9 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  37.1 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  34.52 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  31.53 
 
 
345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.61 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.5 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.35 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.86 
 
 
307 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  36.72 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  36.72 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.73 
 
 
685 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  33.72 
 
 
464 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  36.18 
 
 
306 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  34.75 
 
 
302 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  36.94 
 
 
469 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  38.04 
 
 
460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.41 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  34.49 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.24 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  38.41 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  32.57 
 
 
306 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  38.22 
 
 
309 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.18 
 
 
307 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 
463 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  38.7 
 
 
464 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.41 
 
 
371 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.42 
 
 
369 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.41 
 
 
371 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.42 
 
 
369 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  33.86 
 
 
307 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  35.29 
 
 
707 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  37.72 
 
 
454 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  39.32 
 
 
465 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  39.74 
 
 
306 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  33.86 
 
 
307 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  36.48 
 
 
304 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  35.67 
 
 
310 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.42 
 
 
369 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.28 
 
 
393 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  36.36 
 
 
340 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  37.89 
 
 
457 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>