More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6948 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 333 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  55.48 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.27 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.27 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  54.82 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  54.93 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  43.52 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  41.67 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  45.31 
 
 		 340 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  41.37 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  44.04 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.67 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  42.61 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  41.07 
 
 		 707 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40 
 
 		 685 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.7 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  38.21 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  41.75 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.23 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.38 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.37 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  37.25 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.23 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.33 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  35.69 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  38.51 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.91 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  33.56 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  36.45 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.91 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.37 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  39.66 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  38.36 
 
 		 456 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  35.71 
 
 		 291 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  37.25 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.97 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.97 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.91 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.97 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.15 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.91 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  36.6 
 
 		 455 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.91 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  30.16 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  34.56 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  36.36 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.79 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  37.91 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  34.12 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  36.6 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.24 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  37.22 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  39.26 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  35.62 
 
 		 336 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  35.86 
 
 		 454 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.89 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  38.59 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  31.73 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  35.57 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  39.22 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  33.56 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.79 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  35.08 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  37.22 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  38.24 
 
 		 294 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  38.24 
 
 		 294 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.1 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.04 
 
 		 453 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  36.86 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.16 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  37.2 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  36.24 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  33.55 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  37.16 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  39.73 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  35.71 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.55 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  33.55 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  33.55 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  33.55 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  33.55 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  33.55 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  36.12 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  33.55 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  37.21 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  38.59 
 
 		 756 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  38.61 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  37.7 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  37.54 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  33.88 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  37.99 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  33.88 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  32.47 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  36.39 
 
 		 464 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  33.67 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  37.09 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  36.04 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.52 
 
 		 459 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.09 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>