138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3075 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 344 aa  690    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  69.28 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.65 
 
 		 341 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.75 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  45.05 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  48.8 
 
 		 707 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.67 
 
 		 685 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.99 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.03 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.35 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  32.31 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.7 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  54.78 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.64 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  30.05 
 
 		 411 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.33 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.1 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  25.95 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.64 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  30.33 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  31.63 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  23.77 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  23.45 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.14 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  23.76 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  23.76 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  23.76 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.07 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.66 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.63 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.36 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  23.1 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  23.9 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  23.67 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  23.68 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  23.39 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  24.43 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  23.39 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  25.76 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  23.36 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  41.25 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.44 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  22.88 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.59 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  22.4 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  24.07 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5501  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.54 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205355  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.46 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  28.65 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  26.55 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.21 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.26 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.26 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.46 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  21.21 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  26.24 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  25.39 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.8 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  20.5 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  24.62 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  26.87 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  22.62 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  24.55 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.52 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.4 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25.09 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>