171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1206 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 341 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  52.69 
 
 		 707 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.69 
 
 		 685 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.47 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.73 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.65 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.18 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.75 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.6 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.84 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  55.93 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  29.69 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.97 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  27.61 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.92 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  24.37 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  23.97 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  23.97 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  22.65 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  25.8 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  23.73 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  28.73 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  24.21 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  25.32 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  25.32 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  25.32 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  23.05 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  24.45 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  24.72 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.07 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.28 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.75 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  34.78 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.16 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  22.33 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  21.6 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  24.75 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  24.66 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  23.68 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  24.14 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.52 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  27.39 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  23.83 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.42 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  22.64 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  24.41 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.26 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  23.72 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  23.49 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  24.48 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.61 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  20.31 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  25.83 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  30.41 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  24.17 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.81 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  25.38 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.91 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  25.25 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  20.91 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  23.33 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.16 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.48 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  24.28 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  23.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  27.48 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  25.86 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  23.74 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  28.91 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.58 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  28.37 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  23.13 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.1 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  24.28 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  36.59 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  23.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>