170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1184 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 334 aa  677    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  26.96 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  22.38 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  22.38 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.02 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  26.57 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.62 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.5 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.93 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.34 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.14 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.52 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.49 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  24.65 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  23.33 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.07 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  23.08 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  24.67 
 
 		 383 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.3 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  23.29 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.47 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  23.58 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  25.59 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  21.9 
 
 		 411 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.76 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.54 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.36 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  25.38 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.05 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  28.82 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  21.92 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  23.02 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  24.78 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  21.6 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  23.18 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.46 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  23.23 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  24.8 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  21.14 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  24.72 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  23.08 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  25.2 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  25.2 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.59 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.16 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  31.5 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.35 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.51 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.25 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  23.53 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  23.13 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  23.93 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  23.53 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  24.61 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.04 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.54 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.36 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.72 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.07 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  22.5 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  20.89 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  20.89 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  26.46 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  25.91 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.54 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  23.3 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>