130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1883 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 341 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  69.86 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.79 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.9 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.18 
 
 		 341 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  49.41 
 
 		 685 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  47.34 
 
 		 707 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  45.29 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.21 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.9 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.75 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  55.17 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  29.23 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 355 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.9 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  24.53 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  26.7 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.8 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  24.76 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.96 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  22.7 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.84 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  25.81 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.08 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  24.61 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  25.93 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.93 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  24.08 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  24.17 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  23.46 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  23.41 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  23.59 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  24.32 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  21.21 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.71 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  22.92 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.9 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  22.75 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  23.05 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  22.32 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.35 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  27 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  24.63 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  25.3 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  24.63 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  26.57 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  27.21 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  24.25 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.83 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  23.6 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.83 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  41.98 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.44 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.62 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5501  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.74 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205355  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  35.21 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  21.84 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  34.25 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  23.98 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  29.94 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.33 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  22.49 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  35.21 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  23.88 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.9 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  28.04 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>