143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0340 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 344 aa  712    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.96 
 
 		 337 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.47 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50.89 
 
 		 685 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  48.67 
 
 		 707 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.75 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.49 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.15 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.34 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  45.76 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  26.73 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.52 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  23.85 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.45 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.57 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  23.91 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  24.44 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  21.39 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  23.84 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  26.18 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  22.99 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.73 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.09 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  27.34 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  28.72 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.49 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  39.02 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  39.02 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.17 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  21.59 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.17 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  24.68 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  22.08 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  24.62 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  21.99 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  27.07 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  25.7 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  36.59 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  22.44 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  24.41 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  23.36 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.24 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  24.41 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  22 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  23.85 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  41.56 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  27.54 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  25.46 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  23.64 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  24.6 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.14 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  26 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14020  hypothetical protein  27.62 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  26 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  26 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  27.07 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>