143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3754 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3754  ornithine cyclodeaminase mu-crystallin  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00106555  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.71 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  27.08 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.23 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.06 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  26.18 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.02 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  26.07 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  22.52 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  22.52 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  26.22 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  24.32 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  25.23 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.7 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  24.22 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  26.29 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  24.06 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  25.63 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  24.93 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  25.3 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  27.32 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  24.62 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  23.95 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  23.95 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.87 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  25.62 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  27.21 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  24.01 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.49 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.72 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  23.89 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  21.97 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.36 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  22.36 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  23.08 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  26.41 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  22.67 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.21 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  29.5 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.37 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.87 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  25.98 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  24.79 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.55 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  20.92 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.14 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.91 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  24.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  27.02 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  24.79 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  24.79 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  24.81 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.34 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  26.53 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  23.33 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.55 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  22.73 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  23.53 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.18 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  25.39 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  22.73 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.64 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.4 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>