More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1330 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1330  response regulator receiver  100 
 
 
400 aa  831    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.85 
 
 
2284 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.32 
 
 
1960 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.84 
 
 
2301 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  36.43 
 
 
1989 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.9 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.52 
 
 
1956 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
1010 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
782 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
121 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.1 
 
 
1499 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
756 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
1609 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.89 
 
 
1987 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  39.02 
 
 
705 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  39.52 
 
 
1888 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
1974 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.67 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1284 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.19 
 
 
1971 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  38.05 
 
 
2051 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  37.21 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  36.48 
 
 
2070 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
2026 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.4 
 
 
2336 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
2212 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.73 
 
 
2026 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
2164 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 
231 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  36.84 
 
 
2048 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
121 aa  77  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.26 
 
 
1866 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  41.41 
 
 
302 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
1153 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.07 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
2009 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
2012 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35 
 
 
1131 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 
236 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  41.44 
 
 
1970 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  43.16 
 
 
209 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  32.84 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
2022 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  55.56 
 
 
121 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1431 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
1725 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2856  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
121 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.6 
 
 
2092 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
121 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
1646 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
2414 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
911 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.83 
 
 
1992 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
1907 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.07 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
911 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
1646 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
1725 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.15 
 
 
2458 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1768 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1323 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.15 
 
 
2476 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
1647 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  37.3 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.26 
 
 
1983 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.04 
 
 
770 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.16 
 
 
770 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
2539 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
612 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
1758 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 
569 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.23 
 
 
620 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
807 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1322 aa  73.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1629 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  33.33 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  36.89 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
125 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35 
 
 
121 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  37.4 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  38.81 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>