More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3954 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3954  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 413 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0763531  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2348  RND family efflux transporter MFP subunit  49.23 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1668  secretion protein HlyD  49.72 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2600  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  42.36 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  36.18 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.01 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  28.04 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.04 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.55 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 		 367 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  27.97 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  27.62 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  29.2 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.81 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.25 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.15 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  27.65 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  24.38 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  24.38 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  31.4 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.15 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  28.84 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  28.84 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  28.84 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  24.81 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  25.57 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  24.63 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  21.56 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  29.95 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  21 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  28.95 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28.95 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  21.56 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.84 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  23.88 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  25.76 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  25.2 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  23.88 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  21.7 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  25.45 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  27.41 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  22.22 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  33.95 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>