77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2238 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  48.85 
 
 		 833 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  44.76 
 
 		 778 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  29.37 
 
 		 823 aa  243  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.35 
 
 		 921 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.89 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  24.73 
 
 		 957 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  26.26 
 
 		 953 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  25.23 
 
 		 949 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  27.98 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  26.65 
 
 		 938 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  28.57 
 
 		 902 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 1093 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  26.7 
 
 		 973 aa  124  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  25.49 
 
 		 1146 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1201 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  26.95 
 
 		 1139 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  27.11 
 
 		 1133 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1200 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  23.36 
 
 		 939 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  29.73 
 
 		 903 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1198 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  25.41 
 
 		 1124 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  27.54 
 
 		 1133 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  25.41 
 
 		 1130 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  25.41 
 
 		 1155 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  26.23 
 
 		 850 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  27.5 
 
 		 774 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  27.36 
 
 		 989 aa  98.2  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  32.76 
 
 		 891 aa  97.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  29.15 
 
 		 1312 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1242 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1128 aa  94.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  25.93 
 
 		 946 aa  89.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  23.41 
 
 		 1207 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  22.26 
 
 		 1045 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0187  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1019 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  26 
 
 		 1048 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  25 
 
 		 1045 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1048 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1013 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  28.28 
 
 		 941 aa  70.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1070 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.66 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  25.08 
 
 		 856 aa  68.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1048 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1063 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1065 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1070 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1064 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  26.67 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  25.45 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  30.97 
 
 		 569 aa  54.3  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.28 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.26 
 
 		 954 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  28.26 
 
 		 954 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  24.89 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  24.89 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  25.34 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  25.73 
 
 		 573 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  25.73 
 
 		 573 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  25.73 
 
 		 573 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.28 
 
 		 573 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  22.39 
 
 		 915 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  23.44 
 
 		 906 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 894 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  24.43 
 
 		 573 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.41 
 
 		 2272 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  21.66 
 
 		 915 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  25.81 
 
 		 899 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  26.83 
 
 		 901 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  32.99 
 
 		 268 aa  46.2  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.46 
 
 		 2816 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  26.24 
 
 		 847 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6138  hypothetical protein  37.25 
 
 		 268 aa  44.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0272173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  27.5 
 
 		 920 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  23.08 
 
 		 939 aa  44.3  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>