34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2913 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  100 
 
 		 847 aa  1639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  45.48 
 
 		 934 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  28.8 
 
 		 954 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  29.11 
 
 		 954 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  26.45 
 
 		 894 aa  126  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  27.79 
 
 		 939 aa  96.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  31.01 
 
 		 915 aa  95.5  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  31.01 
 
 		 915 aa  94.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  26.79 
 
 		 884 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  29.89 
 
 		 926 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  24.01 
 
 		 906 aa  88.6  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  33.52 
 
 		 899 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  30.77 
 
 		 910 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  40.69 
 
 		 900 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  40.69 
 
 		 900 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  34.03 
 
 		 901 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.83 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.73 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  31.68 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  28 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  22.62 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  23.81 
 
 		 1312 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.09 
 
 		 778 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  24 
 
 		 949 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  22.82 
 
 		 973 aa  52.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  27.93 
 
 		 587 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 921 aa  51.2  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  29.29 
 
 		 1045 aa  48.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.24 
 
 		 824 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.05 
 
 		 573 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  34.78 
 
 		 1133 aa  45.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  27.34 
 
 		 957 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  31.52 
 
 		 1146 aa  44.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  33.7 
 
 		 1133 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>