63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1764 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  100 
 
 		 587 aa  1171    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  30.03 
 
 		 600 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  31.15 
 
 		 824 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  28.92 
 
 		 833 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  33.42 
 
 		 957 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.32 
 
 		 778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1200 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  29.09 
 
 		 949 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  32.64 
 
 		 938 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  32.22 
 
 		 939 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  31 
 
 		 953 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  31.84 
 
 		 1093 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  35.45 
 
 		 1133 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  35.16 
 
 		 1139 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1201 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  34.16 
 
 		 1146 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  33.72 
 
 		 1133 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.01 
 
 		 1155 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  34.01 
 
 		 1124 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  34.01 
 
 		 1130 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  27.57 
 
 		 973 aa  118  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 921 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  25.55 
 
 		 902 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.7 
 
 		 823 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  31.36 
 
 		 903 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1128 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  30.52 
 
 		 774 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1242 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  31.88 
 
 		 1312 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 989 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  26.74 
 
 		 946 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1198 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  35.44 
 
 		 1207 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  28.32 
 
 		 891 aa  91.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  30.05 
 
 		 941 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  23.54 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  25.96 
 
 		 847 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  31.82 
 
 		 920 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  29.34 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  26.21 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  25.83 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  25.95 
 
 		 899 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  41.89 
 
 		 910 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  38.1 
 
 		 1045 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  24.57 
 
 		 915 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  28.41 
 
 		 926 aa  58.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  26.29 
 
 		 954 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  26.72 
 
 		 954 aa  57  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0607  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1278 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.591386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  23.72 
 
 		 915 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.31 
 
 		 906 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  33.91 
 
 		 901 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  28.65 
 
 		 900 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  22.1 
 
 		 939 aa  51.6  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  28.1 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  21.47 
 
 		 884 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  27.69 
 
 		 900 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1063 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.82 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1070 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1070 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1065 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1064 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>