53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0695 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  100 
 
 		 926 aa  1763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  46.91 
 
 		 893 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  37.97 
 
 		 910 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  38.82 
 
 		 894 aa  144  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  50.29 
 
 		 899 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  50.87 
 
 		 901 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  37.03 
 
 		 900 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  37.03 
 
 		 900 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  38.79 
 
 		 920 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 954 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 954 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  27.15 
 
 		 884 aa  97.8  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  32.17 
 
 		 847 aa  94  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  40.65 
 
 		 906 aa  90.5  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  28.43 
 
 		 939 aa  90.1  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  36.08 
 
 		 1312 aa  89  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  30.55 
 
 		 934 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  32.94 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  33.85 
 
 		 915 aa  75.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  26.71 
 
 		 902 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  28.19 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  22.38 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  23.05 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  23.05 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.7 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  23.84 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  21.71 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 921 aa  55.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  23.71 
 
 		 573 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.76 
 
 		 573 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  41.54 
 
 		 973 aa  53.9  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  24.83 
 
 		 573 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  24.14 
 
 		 573 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.64 
 
 		 573 aa  52  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  31.22 
 
 		 957 aa  51.6  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  35.48 
 
 		 639 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  32.93 
 
 		 939 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.03 
 
 		 778 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.31 
 
 		 938 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1128 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  31.76 
 
 		 824 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  28.21 
 
 		 953 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  25.85 
 
 		 946 aa  48.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1242 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  35.29 
 
 		 601 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 1146 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  22.97 
 
 		 856 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  32.5 
 
 		 569 aa  45.8  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 1130 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 1124 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.29 
 
 		 1155 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>