64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1094 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 902 aa  1779    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  34.64 
 
 		 949 aa  483  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  37.89 
 
 		 957 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.67 
 
 		 973 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  40.29 
 
 		 938 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  37.5 
 
 		 953 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  36.51 
 
 		 903 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  40.98 
 
 		 989 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  33.96 
 
 		 939 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  38.78 
 
 		 1139 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  38.49 
 
 		 1133 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  38.64 
 
 		 1093 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 1124 aa  361  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.72 
 
 		 1155 aa  361  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 1130 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  31.39 
 
 		 946 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  36.74 
 
 		 1133 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  36.25 
 
 		 1146 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  35.62 
 
 		 941 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  35.06 
 
 		 891 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  40.09 
 
 		 1200 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1201 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1128 aa  256  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  38.59 
 
 		 774 aa  253  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  38.43 
 
 		 1198 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1242 aa  227  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  37.04 
 
 		 1207 aa  208  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  25.99 
 
 		 778 aa  152  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  26.79 
 
 		 833 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  27.51 
 
 		 1045 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  28.01 
 
 		 824 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 600 aa  127  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  25.26 
 
 		 823 aa  109  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  26.65 
 
 		 587 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  26.04 
 
 		 921 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 1312 aa  92.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  25.68 
 
 		 850 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  25.35 
 
 		 856 aa  70.1  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  25.87 
 
 		 954 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  25.55 
 
 		 954 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  27.54 
 
 		 934 aa  64.3  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  23.69 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.18 
 
 		 573 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  21.77 
 
 		 573 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  21.77 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  21.77 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.18 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.02 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.58 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.88 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1013 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.49 
 
 		 573 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  24.77 
 
 		 939 aa  55.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  25.44 
 
 		 906 aa  54.7  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  25.22 
 
 		 926 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  24.07 
 
 		 884 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  27.11 
 
 		 915 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  26.27 
 
 		 847 aa  52  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  41.44 
 
 		 569 aa  51.2  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  26.53 
 
 		 915 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1045 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  26.7 
 
 		 893 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  20.88 
 
 		 1048 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>