54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1102 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  100 
 
 
903 aa  1760    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  42.1 
 
 
957 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  43.07 
 
 
953 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  39.03 
 
 
949 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  42.2 
 
 
938 aa  492  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  36.54 
 
 
902 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  37.49 
 
 
939 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  40.1 
 
 
989 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.19 
 
 
973 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  39.48 
 
 
1139 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  40.41 
 
 
1155 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  39.94 
 
 
1093 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  40.41 
 
 
1130 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  40.41 
 
 
1124 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  38.91 
 
 
1133 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  40.06 
 
 
1146 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  39.19 
 
 
1133 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  33.02 
 
 
946 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  47.15 
 
 
1200 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  47.84 
 
 
1201 aa  324  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  37.92 
 
 
941 aa  322  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  41.98 
 
 
1198 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  50.34 
 
 
1207 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  46.7 
 
 
891 aa  281  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  43.03 
 
 
774 aa  273  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  42.82 
 
 
1128 aa  253  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  44.26 
 
 
1242 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  28.78 
 
 
824 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  28.61 
 
 
600 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  31.36 
 
 
587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  29.38 
 
 
833 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  32.4 
 
 
1045 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.93 
 
 
778 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.98 
 
 
921 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
1312 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.1 
 
 
823 aa  84.7  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.62 
 
 
850 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  24.79 
 
 
856 aa  62.4  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.37 
 
 
573 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  25.37 
 
 
573 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  22.39 
 
 
573 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  23.3 
 
 
573 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  30.77 
 
 
573 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  24.89 
 
 
573 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  24.66 
 
 
573 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  23.22 
 
 
573 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  27.72 
 
 
934 aa  52  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  23.98 
 
 
573 aa  51.2  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  23.98 
 
 
573 aa  51.2  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  25.73 
 
 
899 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  35.34 
 
 
954 aa  47.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  35.34 
 
 
954 aa  47.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  30.47 
 
 
1064 aa  47.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  26.78 
 
 
894 aa  44.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>