26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0914 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.35 
 
 		 824 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  26.55 
 
 		 833 aa  94.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.46 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.22 
 
 		 823 aa  78.2  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  25.68 
 
 		 902 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  26.39 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  25.14 
 
 		 1312 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  23.11 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10340  hypothetical protein  34.48 
 
 		 864 aa  57.4  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  24.55 
 
 		 949 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  26.76 
 
 		 973 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  24.37 
 
 		 938 aa  54.3  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  23.66 
 
 		 903 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  26.9 
 
 		 891 aa  52.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  23.26 
 
 		 953 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  24.01 
 
 		 946 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1198 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  24.68 
 
 		 1045 aa  49.7  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  25.28 
 
 		 1133 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  23.26 
 
 		 957 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  25.28 
 
 		 1139 aa  48.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1200 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  28.95 
 
 		 939 aa  45.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  32.1 
 
 		 601 aa  44.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>